Perl+BioPerl

Responsables

Lic. Gonzalo Parra.
Lic. Cristian Rohr
Lic. Franco Simonetti
Lic. Esteban Lanzarotti 

Duración

8 hs (4hs mañana y 4hs tarde)

Cupo

30 alumnos

Nota: Aunque no excluyente y dado la intensividad del workshop recomendamos que los interesados tengan experiencia previa en algún lenguaje de programación.

Programa tentativo:

  1. Introducción aspectos básicos Perl
    Tipos de variables:
         Literales
         Arrays
         Hashes
  2. Estructuras de control
         IF/ELSIF
         WHILE-FOR-FOREACH
  3. Variables internas en Perl
          $_,  @_, @ARGVS y cuando utilizarlas
  4. Funciones utiles:
          split, chop, chomp, substr,otras.
  5. Ejecución de aplicaciones externas
          funcion system, uso de awk y funciones de consola de linux, catch de salidas por consola.
  6. Uso de expresiones regulares
  7. Lectura y escritura de archivos de texto
  8. Realización de gráficos usando GnuPlot
           Diagramas de cajas, Diagramas de dispersión, Heatmaps, Histogramas.
  9. Uso de paquetes
         CPAN
         Compilar e instalar Paquetes
         Ejemplos de uso de paquetes tipicos.
  10. BioPerl
         ¿Que es BioPerl?
          Instalación de BioPerl
          Uso y ejemplos típicos en BioPerl.
        

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